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DNA 元素百科全书 (ENCODE) 项目是一项旨在了解人类基因组功能的全球性努力。随着其最新阶段的完成，ENCODE 项目添加了来自人类和小鼠基因组的数百万个候选 DNA“开关”，这些开关似乎可以调节基因何时何地开启，以及一个分配这些 DNA 开关的一部分的新注册表到有用的生物学类别。该项目还提供了新的可视化工具，以协助使用 ENCODE 的大型数据集。

该项目的最新成果发表在《自然》杂志上，另外还有 13 篇深入研究发表在其他主要期刊上。ENCODE 由隶属于美国国立卫生研究院的国家人类基因组研究所资助。

“ENCODE 3 的一个主要优先事项是开发与更广泛的研究社区共享来自数千个 ENCODE 实验的数据的方法，以帮助扩大我们对基因组功能的理解，”NHGRI 主任 Eric Green 医学博士说。“ENCODE 3 搜索和可视化工具使这些数据易于访问，从而推动了开放科学的发展。”

为了评估不同 DNA 区域的潜在功能，ENCODE 研究人员研究了通常与调节基因的开关相关的生化过程。这种生化方法是快速全面探索整个基因组的有效方法。这种方法有助于定位 DNA 中的“候选功能元素”区域——根据这些生化特性预测为功能元素的 DNA 区域。然后可以在进一步的实验中测试候选物，以确定和描述它们在基因调控中的功能作用。

“ENCODE 的一个关键挑战是不同的基因和功能区域在不同的细胞类型中活跃，”NHGRI 基因组科学部战略实施科学顾问、ENCODE 负责人 Elise Feingold 博士说。研究所。“这意味着我们需要测试大量不同数量的生物样本，以制定基因组中候选功能元素的目录。”